Ambientada en un pueblo algodonero de Sudán, La Reina del Algodón sigue a Nafisa, una joven mujer que ha crecido bajo las enseñanzas de su abuela Al-Sit, matriarca de la comunidad y encargada de la industria algodonera desde que el pueblo logró la liberación de los colonos británicos. Sin embargo, la armonía del pueblo y de Nafisa se pondrá a prueba cuando un empresario extranjero que busca introducir algodón transgénico le pida matrimonio, confrontando a la joven con su legado de resistencia y su despertar emocional.