Basada en una popular saga de novelas infantiles, El árbol mágico sigue a los Thompson, una familia que decide dejar la ciudad para mudarse a una antigua cabaña en medio del bosque. Fran, la hija menor descubre que en ese lugar habita la magia. Al devolverle su bolso a Silky, una simpática hada, ella la invita a conocer un gigantesco árbol donde viven excéntricos personajes y se encuentra una escalera que dirige a distintos mundos fantásticos. Maravillada, convence a sus hermanos y juntos descubren que haberse mudado fue lo mejor que les pasó.